当排便时，粪便挤出肛管需要冲破弹性肛管的阻力，此刻内压会更大。粪便的排出是一个复杂的神经肌肉活动过程，是肛门内，外括约肌，肛提肌交替协作运动的结果。当肌肉的活动发生紊乱时，造成肛管的痉挛，肛管内压升高是许多肛肠疾病发生的重要因素。当肛管发生外伤；手术损伤或者腰椎神经损伤时，可使肛门周围肌肉松驰无力，使肛管内压大幅度下降，从而发生肛门失禁，排便失控。

当肛门内括约肌发生功能紊乱，即肛门痉挛。此时肛门内压力不断升高，此时不仅排便发生障碍，久而久之，还可以发生肛裂，痔血管扩张，以及因肛腺感染而继发形成肛瘘。

当肛门括约肌和盆底肌肉发生功能紊乱时，不仅使肛管直肠内压发生改变，同时也可引起相应的排便功能异常，临床上出口梗阻型便秘的发生，就与肛门括约肌痉挛或者失迟缓，以及盆底肌肉痉挛和松弛等多种因素有关。长时间的肛管直肠内压力的改变还可以造成肛管局部解剖学的异常，发生直肠前突、直肠脱垂、内痔脱垂小肠疝等疾病。

还有一些临床现象说明，肛管内压的增高与某些肛肠疾病有密切关系，经过临床普查发现，早期内痔的患者其肛管内压测定比正常人普遍增高，而肛裂患者肛管内压几乎全部升高，而且治疗肛裂的有效方法是通过手术松紧肛门内括约肌，有效降低肛管内压，使肛裂得到治愈。临床观察还发现，老年人由于肛门内括约肌松弛，肛管内压下降，而很少发生肛裂、肛管感染。反而发生痔脱垂的机会增加。患有直肠前突的患者几乎都存在肛门括约肌痉挛，当排便时粪便下降到肛管时，肛门内括约肌不能松弛，从而粪便排出受阻，并向前方疏松的阴道后壁运动而形成压迫，久而久之造成直肠前突发生，因此直肠前突修补手术同时需要松解部分肛门括约肌，解除肛门痉挛，才能彻底治愈。